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但是，不久前這種傳統的觀點受到了中國科學家的挑戰。經過5年的考察，中國溶洞科學家發現，溶洞的形成和藻類生物有著十分密切的關系，并在此基礎上提出了溶洞形成的“生物建造說”新理論。
生物
巖洞
建造說認為，藻類是一種地球上最早出現，依然廣泛分布的原始植物，它們與其他植物一樣具有匯合作用的能力和趨光生長的特性。因為它們在生長發育過程中會分泌鈣質，可以收集、粘接微細的石灰質顆粒，而且經常集群生活。很多藻類一代又一代地生長在一起，從而形成了許多海洋生物礁。而溶洞中的石鐘乳幾乎都是迎著光線向上彎曲生長的，這符合藻類的趨光生長的特性。石鐘乳、石筍內部還有像樹木年輪一樣的同心圓狀構造，這又可以理解為是藻類生物逐年生長、分泌、收集和粘接石灰質微粒的結果。另外，在有些溶洞的巖石中還找到了近似古代藻類生物的層狀化石結構，在有些溶洞的表層，依然在生長的多種多樣的藻類特征。
巖洞
朗設拉子大學地質系主任穆罕默德·扎雷2007年5月宣布，在伊朗南部霍爾木茲省的格什姆島發現了世界上最長的巖洞。該洞長6580米。
據伊朗國家通訊社報道，穆罕默德·扎雷28日在設拉子舉行的一個新聞發布會上說，此前伊朗在兩年前曾宣布在該國的巴赫爾米特發現了長約5840米的巖洞。
他說，研究表明，格什姆島發現的這個巖洞更長，是目前世界上發現的最大巖洞。
穆罕默德·扎雷表示，伊朗發現許多巖洞這一地質上的奇特現象，將為伊朗吸引許多的旅游者前來參觀。